Namen kombiniranega zdravljenja je izboljšati učinkovitost zdravljenja bolezni, zmanjšati odpornost bakterij, zmanjšati pojavnost neželenih učinkov in razširiti obseg protibakterijskega delovanja. Vendar pa je treba strogo upoštevati indikacije za kombinirano uporabo antibiotikov, kot so mešane okužbe, ki jih ni mogoče nadzorovati z enim samim antibiotikom, kot je peritonitis, ki ga povzroči poškodba trebušnega organa; Hude okužbe, ki jih ni mogoče nadzorovati z enim samim antibiotikom, kot so sepsa, septikemija in druge resne okužbe; Okužbe, v katere je težko prodreti z enim samim antibiotikom, kot je okužba s tuberkulozo; Pri hudih okužbah, pri katerih povzročitelj še ni bil odkrit, lahko dolgotrajno zdravljenje povzroči odpornost na zdravila in zahteva kombinirano zdravljenje. Posebna načela kombiniranja se lahko nanašajo na ustrezne knjige ali literaturo ali upoštevajo zdravniški nasvet.
